该寺现为明、清两代进行了重修，共有40余间楼阁殿宇，从低到高三层叠起，最高处三教殿曾距峡谷深处高达90余米。但由于峡谷河床砂石沉积，现在的高度仅为40余米。
全寺建于悬崖绝壁半腰间的岩石凹陷层中，依山势分为两组;一组自下而上对称分布，有钟楼、鼓楼、送子观音殿、伽蓝殿、地藏殿和千手观音殿，以及同居一室的大雄宝殿(我见过最小的)、太乙殿、关帝殿。另一组是在一组北侧石壁间的两座三层楼阁，有雷音殿、三官殿、纯阳殿。还有儒、释、道“三教归一”的三教殿。
玲珑小巧
嵌入悬崖
悬楼的底基安稳地坐于悬崖凹陷的下部岩石上，其迥廊栈道由三分之二插入石壁的横梁上搭板构成;每根梁下，另加一根插入石壁的隅托梁，非常结实。
手摇木柱
悬空寺还有一奇妙之处：横梁下的支撑木柱，有长有短，有的着力，有的形同虚设，甚至可以晃动。据内行说;这些木柱可不是虚设，一般情况下并不吃力;可一但来人太多，负荷增大，虚柱就会挺身而出，起到一柱承千斤的作用。使悬空寺成了一座似虚而实，似危而安，峻峭险奇的特殊建筑。